Development of an LLM-augmented bioinformatics workflow for transcriptomics-based chemical grouping in support of EFSA risk assessment
European Food Safety Authority
Design, implementation and validation of an end-to-end, LLM-augmented bioinformatics workflow that, given a chemical substance, automatically discovers, downloads and reanalyses transcriptomics datasets from selected public repositories. The system will harmonise key metadata, generate standardised transcriptomic signatures, cluster chemicals based on inferred mode of action, and compare the resulting groups with existing EFSA Cumulative Assessment Groups (CAGs) to support regulatory risk assessment. All code developed will be open source.
ScadenzaIl termine per la ricezione delle offerte era 2026-03-30. L'appalto è stato pubblicato su 2026-02-23.
Chi? Cosa?- • Servizi di ricerca e sviluppo nonché servizi di consulenza affini › Consulenza nel campo della ricerca e dello sviluppo
- • Emilia-Romagna › Parma
- • Luxembourg › Luxembourg
- • Région de Bruxelles-Capitale/ Brussels Hoofdstedelijk Gewest › Arr. de Bruxelles-Capitale/Arr. Brussel-Hoofdstad
Storia dell'approvvigionamento
| Data | Documento |
|---|---|
| 2026-02-23 | Avviso di gara |
| 2026-03-20 | Avviso di gara |
Avviso di gara (2026-02-23)
Oggetto
Ambito di applicazione dell'appalto
Titolo: Development of an LLM-augmented bioinformatics workflow for transcriptomics-based chemical grouping in support of EFSA risk assessment
Numero di riferimento:
Breve descrizione:
Tipo di contratto: Servizi
Prodotti/servizi: Consulenza nel campo della ricerca e dello sviluppo 📦
Valore stimato al netto dell'IVA: 500 000 EUR 💰
Ulteriori restrizioni sul luogo di esecuzione: Ovunque nello Spazio economico europeo
L'appalto si addice anche alle piccole e medie imprese (PMI) ✅
Descrizione
Identificativo interno:
Sede principale o luogo di esecuzione: Please consult the procurement documents.
Durata: 24 mesi
Criteri di assegnazione
Criterio di qualità (nome): Please consult the procurement documents.
Criterio di qualità (ponderazione): 70
Prezzo ✅
Prezzo (ponderazione): 30
Titolo
Numero di identificazione del lotto:
Procedura
Tipo di procedura
Procedura aperta ✅
Base giuridica: Regolamento (UE, Euratom) 2024/2509
Informazioni amministrative
Termine per la ricezione delle offerte o delle domande di partecipazione: 2026-03-30 14:30:59 📅
Condizioni per l'apertura delle offerte: 2026-03-31 14:30:00 📅
Lingue in cui possono essere presentate le offerte o le domande di partecipazione: bulgaro 🗣️
ceco 🗣️
tedesco 🗣️
greco 🗣️
inglese 🗣️
spagnolo 🗣️
estone 🗣️
finlandese 🗣️
francese 🗣️
irlandese 🗣️
croato 🗣️
ungherese 🗣️
italiano 🗣️
lituano 🗣️
lettone 🗣️
maltese 🗣️
olandese 🗣️
polacco 🗣️
portoghese 🗣️
rumeno 🗣️
slovacco 🗣️
sloveno 🗣️
svedese 🗣️
Periodo di tempo minimo durante il quale l'offerente deve mantenere l'offerta: 9 mesi
Condizioni di gara
Data di apertura: 2026-03-31 14:30:00 📅
Fatturazione elettronica: Consentita
Verrà utilizzato l'ordine elettronico ✅
Verrà utilizzato il pagamento elettronico ✅
Termine per la richiesta di informazioni supplementari: 2026-03-20 📅
Criteri di assegnazione
Tipo di ponderazione: Ponderazione (percentuale, esatta)
Amministrazione aggiudicatrice
Nome e indirizzi
Nome: European Food Safety Authority
Numero di registrazione nazionale:
Servizio: EFSA.ED - Executive Director,EFSA.ED.ENABLE - Risk Assessment Services,EFSA.ED.ENABLE.IDATA - Integrated Data
Indirizzo postale: Via Carlo Magno 1A
Codice postale: I-43126
Città postale: Parma
Regione: Parma 🏙️
Paese: Italia 🇮🇹
E-mail: efsaprocurement@efsa.europa.eu 📧
Telefono: +39 0521 036 111 📞
URL: https://www.efsa.europa.eu 🌏
Tipo di amministrazione aggiudicatrice
Istituzione/agenzia europea o organizzazione internazionale
Attività principale
Servizi generali delle amministrazioni pubbliche
Comunicazione
URL dei documenti: https://ec.europa.eu/info/funding-tenders/opportunities/portal/screen/opportunities/tender-details/3f84ebea-5fa4-4a52-a1a7-6e8b8c098e7a-CN?#anchorDocuments 🌏
URL di partecipazione: https://webgate.ec.europa.eu/digit/opsys/esubmission?cftUuid=3f84ebea-5fa4-4a52-a1a7-6e8b8c098e7a 🌏
URL dello strumento di approvvigionamento: https://ec.europa.eu/info/funding-tenders/opportunities/portal/screen/opportunities/tender-details/3f84ebea-5fa4-4a52-a1a7-6e8b8c098e7a-CN?#anchorDocuments 🌏
Nome: Funding and Tenders Portal
Identificativo dell'avviso precedente: 776813-2025
Lingua del documento di gara: inglese 🗣️
Presentazione elettronica delle offerte: Obbligatoria
Informazioni complementari
Informazioni aggiuntive
Corpo di revisione
Nome: Court of Justice of the European Union
Numero di registrazione nazionale:
Indirizzo postale: Rue du Fort Niedergrünewald
Codice postale: L-2925
Città postale: Luxembourg
Regione: Luxembourg 🏙️
Paese: Lussemburgo 🇱🇺
E-mail: gc.registry@curia.europa.eu 📧
Telefono: +352 4303-1 📞
URL: http://curia.europa.eu 🌏
Servizio presso il quale è possibile ottenere informazioni sulla procedura di riesame
Uguale a: Nome e indirizzi
Informazioni sui flussi di lavoro elettronici
Sarà accettata la fatturazione elettronica
Fonte: OJS 2026/S 038-127772 (2026-02-23)
Oggetto
Ambito di applicazione dell'appalto
Titolo: Development of an LLM-augmented bioinformatics workflow for transcriptomics-based chemical grouping in support of EFSA risk assessment
Numero di riferimento:
EFSA/2026/OP/0002
Breve descrizione:
Design, implementation and validation of an end-to-end, LLM-augmented bioinformatics workflow that, given a chemical substance, automatically discovers, downloads and reanalyses transcriptomics datasets from selected public repositories. The system will harmonise key metadata, generate standardised transcriptomic signatures, cluster chemicals based on inferred mode of action, and compare the resulting groups with existing EFSA Cumulative Assessment Groups (CAGs) to support regulatory risk assessment. All code developed will be open source.
Mostra di più
Prodotti/servizi: Consulenza nel campo della ricerca e dello sviluppo 📦
Valore stimato al netto dell'IVA: 500 000 EUR 💰
Ulteriori restrizioni sul luogo di esecuzione: Ovunque nello Spazio economico europeo
L'appalto si addice anche alle piccole e medie imprese (PMI) ✅
Descrizione
Identificativo interno:
EFSA/2026/OP/0002
Sede principale o luogo di esecuzione: Please consult the procurement documents.
Durata: 24 mesi
Criteri di assegnazione
Criterio di qualità (nome): Please consult the procurement documents.
Criterio di qualità (ponderazione): 70
Prezzo ✅
Prezzo (ponderazione): 30
Titolo
Numero di identificazione del lotto:
LOT-0001
Procedura
Tipo di procedura
Procedura aperta ✅
Base giuridica: Regolamento (UE, Euratom) 2024/2509
Informazioni amministrative
Termine per la ricezione delle offerte o delle domande di partecipazione: 2026-03-30 14:30:59 📅
Condizioni per l'apertura delle offerte: 2026-03-31 14:30:00 📅
Lingue in cui possono essere presentate le offerte o le domande di partecipazione: bulgaro 🗣️
ceco 🗣️
+ altri 22
danese 🗣️tedesco 🗣️
greco 🗣️
inglese 🗣️
spagnolo 🗣️
estone 🗣️
finlandese 🗣️
francese 🗣️
irlandese 🗣️
croato 🗣️
ungherese 🗣️
italiano 🗣️
lituano 🗣️
lettone 🗣️
maltese 🗣️
olandese 🗣️
polacco 🗣️
portoghese 🗣️
rumeno 🗣️
slovacco 🗣️
sloveno 🗣️
svedese 🗣️
Condizioni di gara
Data di apertura: 2026-03-31 14:30:00 📅
Fatturazione elettronica: Consentita
Verrà utilizzato l'ordine elettronico ✅
Verrà utilizzato il pagamento elettronico ✅
Termine per la richiesta di informazioni supplementari: 2026-03-20 📅
Criteri di assegnazione
Tipo di ponderazione: Ponderazione (percentuale, esatta)
Amministrazione aggiudicatrice
Nome e indirizzi
Nome: European Food Safety Authority
Numero di registrazione nazionale:
EFSA
Servizio: EFSA.ED - Executive Director,EFSA.ED.ENABLE - Risk Assessment Services,EFSA.ED.ENABLE.IDATA - Integrated Data
Indirizzo postale: Via Carlo Magno 1A
Codice postale: I-43126
Città postale: Parma
Regione: Parma 🏙️
Paese: Italia 🇮🇹
E-mail: efsaprocurement@efsa.europa.eu 📧
Telefono: +39 0521 036 111 📞
URL: https://www.efsa.europa.eu 🌏
Tipo di amministrazione aggiudicatrice
Istituzione/agenzia europea o organizzazione internazionale
Attività principale
Servizi generali delle amministrazioni pubbliche
Comunicazione
URL dei documenti: https://ec.europa.eu/info/funding-tenders/opportunities/portal/screen/opportunities/tender-details/3f84ebea-5fa4-4a52-a1a7-6e8b8c098e7a-CN?#anchorDocuments 🌏
URL di partecipazione: https://webgate.ec.europa.eu/digit/opsys/esubmission?cftUuid=3f84ebea-5fa4-4a52-a1a7-6e8b8c098e7a 🌏
URL dello strumento di approvvigionamento: https://ec.europa.eu/info/funding-tenders/opportunities/portal/screen/opportunities/tender-details/3f84ebea-5fa4-4a52-a1a7-6e8b8c098e7a-CN?#anchorDocuments 🌏
Nome: Funding and Tenders Portal
Identificativo dell'avviso precedente: 776813-2025
Lingua del documento di gara: inglese 🗣️
Presentazione elettronica delle offerte: Obbligatoria
Informazioni complementari
Informazioni aggiuntive
In case of unavailability or disruptions in the functioning of the electronic means of communication provided in Section 5.1.11 in the last 5 calendar days before the time limit for receipt indicated in Section 5.1.12, the contracting authority reserves the right to extend this time limit and publish the extension at the Internet address provided in Section 5.1.11, without a preceding publication of a corrigendum to this notice. Economic operators interested in this procurement are invited to subscribe to the call for tenders at the address in Section 5.1.11 in order to get notified when new information or documents are published.
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Nome: Court of Justice of the European Union
Numero di registrazione nazionale:
CURIA
Indirizzo postale: Rue du Fort Niedergrünewald
Codice postale: L-2925
Città postale: Luxembourg
Regione: Luxembourg 🏙️
Paese: Lussemburgo 🇱🇺
E-mail: gc.registry@curia.europa.eu 📧
Telefono: +352 4303-1 📞
URL: http://curia.europa.eu 🌏
Servizio presso il quale è possibile ottenere informazioni sulla procedura di riesame
Uguale a: Nome e indirizzi
Informazioni sui flussi di lavoro elettronici
Sarà accettata la fatturazione elettronica
Fonte: OJS 2026/S 038-127772 (2026-02-23)
Avviso di gara (2026-03-20)
Oggetto
Ambito di applicazione dell'appalto
Valore stimato al netto dell'IVA: 500 000 EUR 💰
Procedura
Informazioni amministrative
Termine per la ricezione delle offerte o delle domande di partecipazione: 2026-04-20 14:30:59 📅
Condizioni per l'apertura delle offerte: 2026-04-21 14:30:00 📅
Condizioni di gara
Data di apertura: 2026-04-21 14:30:00 📅
Termine per la richiesta di informazioni supplementari: 2026-04-10 📅
Amministrazione aggiudicatrice
Nome e indirizzi
Servizio: EFSA.ED - Executive Director,EFSA.ED.EMPOWER - Management Services,EFSA.ED.EMPOWER.FIN - Financial Services
Informazioni complementari
Servizio presso il quale è possibile ottenere informazioni sulla procedura di riesame
EFSA.ED - Executive Director,EFSA.ED.EMPOWER - Management Services,EFSA.ED.EMPOWER.FIN - Financial Services
Cambiamenti
Altre informazioni aggiuntive
Typos corrected, document updated and deadline extended
Motivo principale della modifica: Rettifica errore committente
Informazioni sulle modifiche
Versione dell'avviso precedente da modificare: 90de128d-cbe7-4c89-b80b-071a75deddb8-01
Fonte: OJS 2026/S 057-198141 (2026-03-20)
Oggetto
Ambito di applicazione dell'appalto
Valore stimato al netto dell'IVA: 500 000 EUR 💰
Procedura
Informazioni amministrative
Termine per la ricezione delle offerte o delle domande di partecipazione: 2026-04-20 14:30:59 📅
Condizioni per l'apertura delle offerte: 2026-04-21 14:30:00 📅
Condizioni di gara
Data di apertura: 2026-04-21 14:30:00 📅
Termine per la richiesta di informazioni supplementari: 2026-04-10 📅
Amministrazione aggiudicatrice
Nome e indirizzi
Servizio: EFSA.ED - Executive Director,EFSA.ED.EMPOWER - Management Services,EFSA.ED.EMPOWER.FIN - Financial Services
Informazioni complementari
Servizio presso il quale è possibile ottenere informazioni sulla procedura di riesame
EFSA.ED - Executive Director,EFSA.ED.EMPOWER - Management Services,EFSA.ED.EMPOWER.FIN - Financial Services
Cambiamenti
Altre informazioni aggiuntive
Typos corrected, document updated and deadline extended
Motivo principale della modifica: Rettifica errore committente
Informazioni sulle modifiche
Versione dell'avviso precedente da modificare: 90de128d-cbe7-4c89-b80b-071a75deddb8-01
Fonte: OJS 2026/S 057-198141 (2026-03-20)
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